Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYV3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYV3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYV3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYV3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYV3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V9GYV3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V9GYV3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V9GYV3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V9GYV3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
V9GYV3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms