Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC61Q9Y6R9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC61Q9Y6R9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms