Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN6Q9Y6Q1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN6Q9Y6Q1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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