Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms