Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJA3Q9Y6H8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJA3Q9Y6H8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms