Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX9Q9Y5X1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX9Q9Y5X1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms