Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL4A3BPQ9Y5P4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms