Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHLDA3Q9Y5J5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHLDA3Q9Y5J5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms