Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms