Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP15Q9Y4E8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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