Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNSTRNQ9Y448 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KNSTRNQ9Y448 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms