Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX2Q9Y2T7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
YBX2Q9Y2T7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YBX2Q9Y2T7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX2Q9Y2T7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX2Q9Y2T7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX2Q9Y2T7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX2Q9Y2T7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms