Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms