Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC2Q9Y235 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC2Q9Y235 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms