Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM35Q9UPQ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM35Q9UPQ4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
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