Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNRGQ9UMZ2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SYNRGQ9UMZ2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms