Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX12Q9UMY4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX12Q9UMY4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms