Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHTF1Q9UMS5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHTF1Q9UMS5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms