Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BARX2Q9UMQ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms