Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AMFRQ9UKV5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms