Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHIC2Q9UKJ5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHIC2Q9UKJ5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHIC2Q9UKJ5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms