Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSRAQ9UJ68 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms