Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HMGXB4Q9UGU5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HMGXB4Q9UGU5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms