Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFT172Q9UG01 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IFT172Q9UG01 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IFT172Q9UG01 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms