Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLA2Q9P2R7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLA2Q9P2R7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms