Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMOD2Q9NZR1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD2Q9NZR1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMOD2Q9NZR1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms