Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGA3Q9NZ52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms