Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR4Q9NYA4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR4Q9NYA4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms