Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNTG2Q9NY99 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNTG2Q9NY99 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms