Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPD3Q9NY59 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms