Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms