Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDIT4Q9NX09 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDIT4Q9NX09 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms