Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ASF1BQ9NVP2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ASF1BQ9NVP2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms