Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM140Q9NV12 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms