Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8A2Q9NTI2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms