Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL17Q9NRX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL17Q9NRX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms