Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRN4Q9NRL3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRN4Q9NRL3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms