Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
DUOX2Q9NRD8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms