Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST12Q9NRB3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHST12Q9NRB3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms