Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CYLDQ9NQC7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYLDQ9NQC7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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