Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRC4Q9NPP4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRC4Q9NPP4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms