Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB18Q9NP72 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB18Q9NP72 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms