Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOBEC3GQ9HC16 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms