Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SENP3Q9H4L4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SENP3Q9H4L4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms