Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRABDQ9H4I3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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