Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXF3Q9H4D5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms