Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIOBPQ9H2D6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms