Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSG1Q9H089 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSG1Q9H089 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms