Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms