Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM31Q9BZY9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM31Q9BZY9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms